Jste Gordon Freeman, ať se vám to líbí, nebo ne. Právě jste se probudil v kabince nějakého vláčku visícího na jedné koleji. Jste v celém vagónu sám. Okny vidíte do nějakého komplexu. Z reproduktoru u dveří se ozývá ženský hlas, který vám oznamuje informace o komplexu Black mesa, ve kterém se právě nacházíte. Je to někde v nevadské poušti a zaměřuje se to na fyzikální pokusy a testy, případně výzkumy. Americká vláda do toho investuje miliardy dolarů ročně. Jedete dál vláčkem, a během zpracovávání informací z toho reproduktoru si prohlížíte okny prostory, kterými projíždíte. Projíždíte dokonce různými airlocky, mění se horní a dolní kolejní pohon, občas uvidíte jinou kolej, na které je jiný vagon. Ale támhleten muž... Má modrý oblek a podivný kufřík, vyhlíží, jakoby vás sledoval... Ale vy si ho nevšímáte, je to nejspíš jen další zaměstnanec. Po nějaké době putování komplexem poprvé vidíte nebe. Je to zrovna tehdy, když vidíte, jak někdo na place pod vámi testuje novou helikoptéru, o kterou má zájem armáda. Poté už nadobro zmizíte v hlubinách komplexu. Zastavíte se ve vysoké a prázdné místnosti s kusem otevřené chodby trčící do prostoru ke koleji., kde vám reproduktor oznámí, že jste na místě a máte vyčkat příchodu nějaké autorizované osoby. Za chvíli přijde jeden člen bezpečnosti Black mesy, napíše PIN na dveře a vy vystoupíte. Jdete po tom širokém kusu podlahy až dojdete k nějakým masivním olověným dveřím. Strážník si stoupne k panelu, kde napíše už mnohem delší kód a dveře se začnou otevírat. Jakmile vejdete do malé místnosti s dalšími dveřmi, ty první se zavřou. Po chvilce se otevřou ty druhé a před vámi se rozkládá vstupní hala nějakého oddělení Black mesy. Přímo před vámi je obrovský monitor s logem black mesa, u něj je ke dveřím orientovaný stůl, za kterým bokem k vám sedí strážník s monitorem před sebou. Jsou tam také dva nějací vědci. V jednom z nich poznáváte Doktora Kleinera, vašeho přítele. Potom poznáváte také Eliho Vance, též vašeho přítele. Procházíte se chodbami až dojdete ke hlídaným proskleným dveřím s airlockem, skrz které vidíte na protější válcovou místnost s válcovým výtahem uprostřed. Strážník, ve kterém poznáváte Barneyho (opět přítel), vám říká, že takhle tam jít nemůžete, že si musíte obstarat nějaký HEV oblek. Tak jdete do šaten, kde jsou i sprchy, toalety a tři HEV jednotky, kde jenom jedna z nich obsahuje HEV oblek. Tak na panelu odemknete oblek a vezmete si ho. Opět jdete za Barneym a ten si nechá na panelu vedle něj oskenovat sítnici, načež hrubý hlas oznámý "Acces autorised" a airlock se otevře. Vy jdete do výtahu, kterým sjedete do testovacího sektoru. Jdete chvilku cestou, kam vás ukazatele zavedou. Cestou si všímáte různých složitých zařízení. Když procházíte místností s aparaturou pro okamžitou destilaci a měřícími mechanismy, vidíte dva vědce, kteří spolu mluví. Najednou praskne něco na panelu za rohem, načež se k tomu oba vědci rozeběhnou, aby zjistili, že se nějaké měřidlo pokazilo. Tak jdete dál, jedete dalším výtahem, procházíte další chodbou, dokud nenarazíte na místnost, kde už na vás čekají Izzy Kleiner i Eli Vance. Na jedné straně místnosti vidíte okénko, skrz které se podíváte na obrovskou válcovitou místnost s podlahou využitou nějakou odetailovanou dírou a stropem pro podivný částice chrlící stroj. Také je tam žebžík na plošinku s panelem... Máte neblahé tušení, že právě tam budete stát. Jdete dále do dalších místností až dojdete do malé krychlové místnosti se dvěma dveřma, dvěma panely pro sken sítnice a jedněma masivníma dveřma. Stojí tam také opět Eli a Izzy, kteří vám řeknou o tom, že dnes se bude testovat v "Rezonanční kaskádě" krystal, který jim nedávno předal jejich vysoký nadřízený Wallace Breen. Tak si každý z nich stoupne ke skenu, přiloží oči a hrubý hlas promluví "Acces autorised". Tak vstoupíte právě do té vámi obávané válcovité místnosti (Ty dveře se za vámi samozřejmě zavřou). Chvilku čekáte, když od toho okénka, ze kterého jste se před chvílí díval, se ozve zesílený hlas. Nejdřív je to testování mikrofonu, poté instrukce, ať vylezeš po tom obávaném žebříku na tu obávanou plošinku a čekáš u toho obávaného panelu, na kterém se nachází páčka pod poklopem. Hlas oznámí začátek první fáze. Roztočí se nějaké válečky kolem obrovského chrliče částic na stropě. Hlas oznamuje fázi dvě, načež se mezi těmi šesti válci rozsvěcí podivné oranžové blesky. Fáze tři znamená obrovský částicový paprsek mezi dírou v podlaze a chrličem částic. Fáze čtyři je, že musíš zmáčknout obávanou páčku pod právě otevřeným poklopem. Tak tedy mačkáš. Jediný efekt je, že se konečně objevý paprsky mezi zbývajívími součástkami toho stroje. Také se vysune v nějakém korýtku elektrický podavač s výše zmiňovaným krystalem v uchycovačích. Máš ho prý tím korytem dosunout až do středu té díry. Tak tedy tlačíš na vozík. Jakmile dojde ke kontaktu krystalu s paprskem, začne rezonanční kaskáda. Ale teď je něco jiné. Nebo aspoň ten obrovský částicový výbuch z toho krystalu je netypycký. A ten váš teleport do temnoty také. Tak s sebou necháte chvilku házet z dimenze do dimenze, přičemž vás několikrát málem bez vašeho ovlivnění zabijou. Ale nakonec se přece oběvíte v komoře pro rezonanční kaskádu, ve které se s překvapením setkáte se zelené blesky chrlící potvorou, která vypadá poněkud naštvaně. Tak zdrháte k těm masivním dveřím vypáčeným masivním výbuchem, kde se dostáváte do jinak slepé místnosti. Zde je smrt, ale tam je smrt ještě horší. Co kdyby za vámi ta potvora šla? Zkoušíte napodobit doktora Kleinera a podívat se do toho skenu. Ten oznámí hrubým hlasem "Acces denied... chrzzz. pspt... Chržtpsssss... Bum!" A dveře se otevšou trhaným, ale přecejenným pohybem. Utíkáte po všech chodbách zpět, kde narážíte na různé mrtvoly původních zaměstnanců Black mesy. Je tam i pár živých lidí, ale těch moc není. Řítíte se po chodbách, kde za vámi vybuchují panely, pomalu se posouváte chodbou, kde laser vypouštěný poškozenou zrcadlovou trubicí řeže také ty panely, případně těla nebohých strážníků, utíkáte po místnostech, kde po vás skáčou na první pohled grilovaná kuřata, a tak dále. Najednou jste v malé válcovité místnosti s výtahem, kde jeden strážník střílí na zmrzačená těla s těmi grilovanými kuřaty (headcrab) na hlavě, sunoucí se jako zombie. Tak pomůžete tomu strážníkovi páčidlem, které jste dostal před chvílí, a pár zombií také zabijete. Tak jdete až do vstupní haly, kde jedna zombie zabila toho strážníka, tak si od něj vezmete pistoli a té zombii ustřelíte hlavu (spíše toho headcraba). Prolezete jednoduchou klimatizací do vedlejší místnosti, která byla bezpečnostní centrum, než to tam začalo bouchat. Také je tam pár headcrabů, tak je umlátíte páčidlem a jdete po chodbách dál. Postupně narážíte na růžnější potvory, jako třeba ty výše zmíněne potvory se zelenými blesky (Vortigaunti), sonické pejsky, barnacly (visící ze stropu s jazykem až k zemi, přitahující a žrající všechno, co se na ten jazyk přilepí), kyselinu chrlící krokodýli, a to všechno z planety Xen, ze které pochází i ten krystal. Jdete chodbou a najednou... Opět ten muž. Stojí na balkónku v tom modrém obleku a s tím kufříkem. Najednou zachází za roh. S překvapením zjišťujete, že ten roh je slepý a že se tamtudy prostě nedá odejít. Potom prostě chodíte po tom komplexu, spouštíte různé obvody, zabíjíte potvory, snažíte si vytvořit cestu, apod. Jenže o té nehodě se dozvěděla i americká vláda, která tam vyslala armádu, mající za úkol zničit vše co je živé nebo co není mrtvé. To poznáte tak, že se mnohokrát utkáte s vojáky US Army v souboji se zbraní. Také se můžete setkat s tou helikoptérou, kterou jste viděl při cestě do Black mesy. Při dalším cestování skrze komplex se potkáte s neuvěřitelným genetickým pokusem nebo s neuvěřitelnou potvorou z Xenu, která ve válcové místnosti doslova třemi chapadly prorůsta skrze zem a mlátí drápy na konci do všeho, co se hýbe. Rychle do místnosti proběhnete, pozapínáte pár přívodů, opět se tam vrátíte a spálíte to obrovskou tryskou. Projdete skrze díru, která po tom zbyla... No a zase procházíte dál, likvidujete různými způsoby různé potvory, a dál. Narazíte na ovládací panel satelitu Lambda, kterým můžete vyslat do vesmíru satelit Lambda, který dokáže usměrnit portálovou bouři. Tak ho v dobré vůli odešlete a s hrůzou zjistíte, že okupantská rasa Combine právě okoupila Xen a chystá se na Zemi. Takže ste jim nevědomky společně s Wallacem Breenem (který to ale udělal vědomě) otevřeli dveře a prodali jste jim zemi. Po nějakém čase se přenesete na planetu Xen, kde vás čeká něco krásného. Na to si ale nepamatuji. Jen vím, že zabijete vůdce vortigauntů a správce Xenu, Aunthulu (na zemi to bude Wallace breen, vládce lidí, správce země). Pak se po nějaké chvíli opět přenesete na zemi...
Před vámi se objeví ten muž v modrém obleku a s kufříkem, který si říká G-man a dá vám na výběr. "Můžete si vybrat mezi jistou smrtí a prácí pro mě". řekne. Obrazovka tmavne a ozývá se hudba titulků.

Nashledanou za pár let, pane Freemane.